福建省兒童醫院是我省衛生健康領域開工建設民生補短板項目的重中之重，列入《福建省“十三五”衛生計生事業發展專項規劃》，納入省政府立項掛牌辦理內容。醫院將建成為集醫療、預防、保健、康復、科研、教學于一體，引入一站式醫療體驗、全時間生理監護、網絡化遠程醫院、數字化手術中心、自動化物流系統等智慧服務設計理念，符合國家兒童區域醫療中心設置標準的大型專業的兒童醫院。

醫院各建筑單體通過醫療主街相聯，由南往北設有南病房樓、醫技樓、北病房樓和科研行政醫學中心，醫療街往東設有門診樓和配套用房及教學交流中心，鳥瞰建筑的外輪廓近似半個圓環，構建出“虛圓實方”的整體建筑造型。設計方案榮獲2017年中國醫院建設匠心獎年度優秀項目。醫院在病房、走道、公區均采用了抗菌醫療板作為護墻板，使用面積約5萬平米，抗菌醫療板防潮防霉，耐污抗菌，提供健康、潔凈的空間。